Що таке аналіз збагачення метаболічних шляхів?
У метаболоміці часто використовують аналіз збагачення набору метаболітів (MSEA). використовується для ідентифікації змінених метаболічних шляхів (наборів метаболітів), пов’язаних із цікавими фенотипами (POI), наприклад, хворобою. Однак у більшості досліджень MSEA страждає від обмеження низького охоплення метаболітом. 9 серпня 2023 р.
Аналіз збагачення шляху (подібний до MSEA) визначає, які метаболічні шляхи мають сполуки (зі вхідних списків), які є надмірно представленими та мають значні порушення їх концентрацій.
Аналіз збагачення шляхів допомагає дослідникам отримати механічне уявлення про списки генів, створені в результаті експериментів у масштабі генома (omics). Цей метод ідентифікує біологічні шляхи, які збагачені в списку генів більше, ніж можна було б очікувати випадково.
Аналіз збагачення набору метаболітів (MSEA). метод, розроблений, щоб допомогти дослідникам метаболомії ідентифікувати та інтерпретувати моделі змін концентрації метаболітів біологічно значущим чином.
Аналіз збагачення набору генів був розроблений, щоб зосередитися на змінах експресії в групах апріорно визначених наборів генів. Роблячи так, цей метод вирішує проблему невизначуваних невеликих змін у експресії окремих генів.
Збагачення клітин істотно щоб відібрати один цільовий тип клітин із зразка клітин, змішуючи кілька типів клітин, включаючи рідину організму, як-от кров.