Що таке білок секвенування наступного покоління?
Наступне покоління
є термін, який використовується для визначення досягнень у з'ясуванні амінокислотної послідовності білків на основі мас-спектрометрії, можливий завдяки інтеграції зі штучним інтелектом, щоб отримати секвенування білка de novo.
Секвенування наступного покоління (NGS). технологія масового паралельного секвенування, яка забезпечує надвисоку пропускну здатність, масштабованість і швидкість. Технологія використовується для визначення порядку нуклеотидів у цілих геномах або цільових областях ДНК чи РНК.
Відмінності між NGS і qPCR Під час порівняння технологій секвенування наступного покоління (NGS) і кількісної ПЛР (qPCR) ключовою відмінністю є сила відкриття. Хоча обидва забезпечують високочутливе та надійне виявлення варіантів, qPCR може виявляти лише відомі послідовності.
Кожен включений нуклеотид ідентифікується своєю флуоресцентною міткою. Критичною відмінністю між секвенуванням Сенгера та NGS є обсяг секвенування. У той час як метод Сенгера секвенує лише один фрагмент ДНК за раз, NGS є масово паралельним, тобто секвенування мільйонів фрагментів одночасно за прогін.
Як виконується аналіз послідовності білка? Аналіз білкової послідовності включає такі методи, як мас-спектрометрія, деградація за Едманом, а останнім часом – передові технології секвенування білка, такі як одномолекулярне секвенування білка, яке точно визначити порядок амінокислот у білковому ланцюзі.
По суті, ви берете свій зразок ДНК і фрагментуєте його на маленькі шматочки.Два ланцюги роз’єднуються, і відбувається контрольована хімічна реакція для додавання комплементарних основ ДНК назад, одну за одною, до одного ланцюга, щоб створити подвійний ланцюг. Коли додається кожна основа, виділяється хімічний або флуоресцентний сигнал.