Що таке консенсусна послідовність інтрона?
Ці консенсусні послідовності включають майже інваріантні динуклеотиди на кожному кінці інтрона, GT на 5' кінці інтрона та AG на 3' кінці інтрона. Найпоширеніший клас нонконсенсусу
сайти складаються з 5' сайтів сплайсингу з динуклеотидом GC (Wu and Krainer 1999).
Інтрон – це будь-яка нуклеотидна послідовність у гені, яка не експресується або не діє в кінцевому продукті РНК. Слово інтрон походить від терміна внутрішньогенна область, тобто область всередині гена. Термін «інтрон» стосується як послідовності ДНК у гені, так і відповідної послідовності РНК у транскриптах РНК.
Теоретична репрезентативна послідовність нуклеотидів або амінокислот, у якій кожен нуклеотид або амінокислота є тією, яка найчастіше зустрічається на цьому сайті в різних послідовностях, які зустрічаються в природі. Фраза також відноситься до фактичної послідовності, яка наближається до теоретичного консенсусу.
Консенсусна інтронна послідовність для 3'-сайту сплайсингу у людей така C/U, AG, і йому часто передує поліпіримідиновий тракт, хоча, оскільки він відбувається в 5'-сайті сплайсингу (також називають донорним сайтом), завжди присутній лише динуклеотид безпосередньо поруч з екзоном [12] .
визначення інтрона (проміжної послідовності). Сегмент ДНК із значною мірою невідомою функцією в гені, який спеціально перериває кодуючі (екзонні) послідовності цього гена.
Інтрони видаляються з первинних транскриптів шляхом розщеплення на збережених послідовностях, які називаються сайтами сплайсингу. Ці сайти знаходяться на 5'- і 3'-кінцях інтронів.Найчастіше видаляється послідовність РНК починається з динуклеотиду GU на його 5' кінці і закінчується AG на його 3' кінці.