Яка структура інтронів 2 групи?
Характеризується вторинна структура інтронів II групи шість типових структур стовбурової петлі, які також називають доменами I-VI (DI-DVI або D1-D6). Домени випромінюються від центрального ядра, яке поєднує 5' і 3'
розв'язки в безпосередній близькості.
Загалом ці елементи зустрічаються в усіх трьох сферах життя: інтрони групи I присутні в бактеріях, бактеріофагах та еукаріотах (органелярні та ядерні геноми), тоді як інтрони групи II присутні в бактеріях, археях та еукаріотичних органелах.
Сплайсосомальні інтрони та інтрони групи II, що самосплайсуються, мають загальний механізм сплайсингу інтронів, де дві послідовні реакції переетерифікації видаляють інтронні ларіати та зв'язують екзони. Нещодавня революція в кріоелектронній мікроскопії (кріо-ЕМ) дозволила візуалізувати ядро рибозиму сплайсосоми.
Архітектура інтронів I групи. Інтрони групи I мають спільне консервативне ядро, яке містить активний сайт сплайсингу [8]. Послідовність ядра організована у два спіральні домени, що містять парні (P) ділянки P4-P5-P6 і P3-P7-P9 (Малюнок 1) [9].
Основна відмінність між інтронами групи I та групи II полягає в тому механізм їх зрощення; Інтрони групи I самосплайсуються без білків, тоді як інтрони групи II зазвичай потребують власних кодованих білків для сплайсингу.
Інтрони ІІ групи — це мобільні рибозими бактерій, які проникають у геноми шляхом зворотного сплайсингу та зворотної транскрипції. Вони можуть представляти предків еукаріотичних сплайсосом і ретротранспозонів.