Що таке розпад нерівноважного зв’язку?

2024 admin 0 Comments

Порушення рівноваги зчеплення (LD) відноситься до невипадкові асоціації алелей у різних локусах. У класичному популяційно-генетичний

популяційно-генетичний

Популяційна генетика є підрозділ генетики, який займається генетичними відмінностями всередині та між популяціями, і є частиною еволюційної біології. Дослідження в цій галузі біології вивчають такі явища, як адаптація, видоутворення та структура популяції.

https://en.wikipedia.org › wiki › Популяційна_генетика

сенсі, на розпад LD впливає швидкість рекомбінації та кількість поколінь рекомбінації. Таким чином, дослідження розпаду LD може виявити історію рекомбінації населення.

Порушення рівноваги зв’язків (LD) — це термін, створений для опису невипадкова асоціація між алелями генетичних локусів, які знаходяться поблизу один від одного.

Якщо LD розпадається на великих відстанях, для картування асоціацій необхідно менше маркерів, що призводить до нижчої роздільної здатності. І навпаки, якщо LD швидко розпадається на короткій відстані, для асоціативного відображення потрібна більша кількість маркерів і роздільна здатність вища [61] .

Порушення рівноваги зчеплення, або LD, є міра ступеня невипадкової асоціації між алельними формами в двох різних місцях (або локусах) у геномі. На це впливають два фактори: мутація та рекомбінація.

Великі значення r2 вказують на сильніший зв’язок між алелями, а нижчі значення r2 вказують на слабкий зв’язок між алелями. Порогове значення на основі r2 (наприклад, r2 ≥ 0,8) можна використовувати для визначення того, чи є два SNP незалежними.

Порушення рівноваги зчеплення (LD) відноситься до невипадкових асоціацій алелей у різних локусах. У класичному популяційно-генетичному розумінні, на розпад LD впливає швидкість рекомбінації та кількість поколінь рекомбінації.